荣小娟.基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂对骨质疏松症的作用机制研究[J].实用中西医结合临床,2024,24(9): |
基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂对骨质疏松症的作用机制研究 |
基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂对骨质疏松症的作用机制研究 |
投稿时间:2024-03-20 修订日期:2024-03-20 |
DOI: |
中文关键词: 网络药理学 分子对接技术 复方骨疏康 骨质疏松症 |
英文关键词: |
基金项目:1.江西科技学院校级教育教学项目--基于网络药理学和分子对接技术研究中药复方骨疏康对骨质疏松症的作用机制研究(项目编号ZR2113)。2.江西省中医药管理局科技计划项目--基于PI3K/Akt/mTOR信号通路探讨复方骨疏康制剂对绝经后骨质疏松症的影响(项目编号2023B1326) |
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摘要: 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂质量骨质疏松症的分子机制。方法:通过TCMSP数据库中筛选出复方骨疏康制剂中各药材的活性成分及所对应的靶点;从 GeneCards 、 OMIM、DrugBank、PharmGKB、TTD数据库中收集骨质疏松症的治疗靶点。通过R语言获得复方骨疏康-骨质疏松症共同靶点。将共同靶点输入至STRING数据库进行检索获取靶点间相互作用的网络关系数据,再利用 Cytoscape 软件得到治疗骨质疏松症的关键核心靶点;通过R语言对交集基因进行GO和KEGG进行可视化分析。同时构建“复方骨疏康-主要通路-骨质疏松症”核心靶点网络。通过AutoDock Vina 分子对接软件进行对接和模拟计算。再使用Pymol 3D绘制软件和Discovery Studio软件对部分对接结果进行三维和二维角度的作用力分析和可视化。结果:筛选出中药复方骨疏康128种活性成分、1614个骨质疏松症相关的靶点,最终筛选出7个关键核心靶点(依据拓扑学属性),GO和KEGG富集分析发现其功能主要与成骨骨化、腺体发育、对外源性刺激等反应有关,富集在:化学致癌-受体激活通路、癌症中的MicroRNAs 通路、MAPK信号通路。分子对接显示:EGFR蛋白与小分子luteolin和quercetin、STAT1蛋白与小分子kaempferol和quercetin、MAPK3和FOS蛋白分别与小分子naringenin和quercetin之间均结合稳定。结论:骨疏康制剂主要通过作用于钙信号通道,MAPK信号通道对骨质疏松症发挥防治作用。 |
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